华大智造仪器使用成本低于 Illumina。随着产品国产化的逐步推进，公司在测序仪、测序试剂等方面已实现部分高价值原材料的国产化，已经具备一定的成本优势。有韩国研究团队发表题为“Comparative analysis of seven short-reads sequencing platforms using the Korean Reference Genome:MGI and Illumina sequencing benchmark for whole-genome sequencing”文献，文中对比了华大智造两款仪器与 Illumina 五款仪器，结论除了说明华大智造仪器能力与 Illumina 类似外，更是指出华大智造仪器成本仅有对方一半，具有更高的性价比。
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